一级保护植物：银杏、水杉、珙桐、光叶珙桐、资源冷杉、红豆杉属所有种、伯乐树、水松。

二级保护植物：樟树（香樟）、油樟、楠木、厚朴、杜仲、黄杉属所有种、榧属所有种、蓖子三尖杉、柔毛油杉、长柄双花木、香果树、伞花木、福建柏、鹅掌楸、金钱松、白豆杉、水青树、半枫荷、闽楠、润楠、绒毛皂荚、凹叶厚朴、任木（任豆）、花榈木、毛红椿、喜树、长果安息香、榉树、秤锤树、黄檗、川黄檗（黄皮树）、连香树、喙核桃、长瓣短柱茶、独花兰、马蹄参、巴东木莲、长果秤锤树。

三级保护植物：檫木、桂花、斑竹、山拐枣、云山椴树、穗花杉、舌柱麻、白桂木、华南栲、沉水樟、黄莲、华榛、金钱槭、八角莲、领春木、天麻、黏木、黄枝油杉、小花木莲、红花木莲、红豆树、乐东拟单性木莲、青檀、白辛树、紫茎、银鹊树、南方铁杉、巴山松、江南油杉、岩生红豆树、巨紫茎、银钟树、中华五加、青钱柳、红花木兰、金叶白兰花、白克木、香桦、湖南石槠、金毛柯、湖南山核桃、山羊角树、东方古柯、小花木兰、天师栗、滇楸、巨紫薇、方竹、紫竹、五味子、石斛、蔓荆子、紫草、龙胆、天门冬、天竺桂、阴香、川桂皮、细叶香桂、柴桂、薯蓣、黄山药、柴黄姜、山萆解、黄精。